38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0305 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0305  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  100 
 
 
41 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.673126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  75 
 
 
41 aa  60.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  70.73 
 
 
41 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0079  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  70 
 
 
42 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  61.11 
 
 
125 aa  51.2  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1284  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  62.5 
 
 
55 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.1144  normal  0.0192641 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  52.78 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  52.78 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  63.33 
 
 
216 aa  47.4  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  59.38 
 
 
124 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  55.26 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1576  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  55.26 
 
 
39 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.154882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  54.55 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  61.29 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  52.78 
 
 
55 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  45.95 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  58.06 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  52.78 
 
 
55 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  52.78 
 
 
55 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  54.84 
 
 
125 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  50 
 
 
126 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1636  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  60 
 
 
47 aa  44.3  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  55.88 
 
 
127 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  58.06 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  65.52 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  58.62 
 
 
214 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  45.95 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  65.52 
 
 
215 aa  43.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  44.74 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  44.74 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  40.54 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  64.29 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0162  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  60.61 
 
 
38 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  50 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  55.88 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  58.62 
 
 
215 aa  40.8  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  57.58 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  47.22 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>