69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3891 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  100 
 
 
125 aa  254  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  69.35 
 
 
126 aa  181  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  68 
 
 
126 aa  180  6e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  68 
 
 
126 aa  178  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  65.6 
 
 
126 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  68.8 
 
 
127 aa  173  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  62.9 
 
 
126 aa  170  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  64.52 
 
 
125 aa  170  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  61.16 
 
 
126 aa  167  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  61.29 
 
 
126 aa  163  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  61.6 
 
 
126 aa  161  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  60 
 
 
124 aa  159  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  58.4 
 
 
126 aa  159  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  59.2 
 
 
124 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  60 
 
 
126 aa  158  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  58.06 
 
 
131 aa  157  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  58.87 
 
 
124 aa  157  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  60 
 
 
125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  57.6 
 
 
124 aa  151  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  55.65 
 
 
126 aa  147  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  55.2 
 
 
131 aa  147  5e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  56.45 
 
 
125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  54.47 
 
 
126 aa  143  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  49.6 
 
 
127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  52.8 
 
 
126 aa  137  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  49.19 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  44.72 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  45.6 
 
 
128 aa  110  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  42.5 
 
 
124 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  41.8 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  40.94 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  40 
 
 
126 aa  90.1  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  45.24 
 
 
121 aa  82  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  41.67 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  37.7 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  42.55 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  27.7 
 
 
187 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.02 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  33.91 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.64 
 
 
115 aa  52.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.74 
 
 
118 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.68 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  33.68 
 
 
118 aa  50.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  37.25 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  58.82 
 
 
41 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.74 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0079  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  65.52 
 
 
42 aa  47.4  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  31.48 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  29.91 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  62.07 
 
 
41 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  29.91 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  32 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  25.62 
 
 
200 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1636  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  38.3 
 
 
47 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  56.67 
 
 
55 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  56.67 
 
 
55 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  48.72 
 
 
214 aa  45.1  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0305  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  54.84 
 
 
41 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.673126 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0162  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  57.58 
 
 
38 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  56.67 
 
 
55 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.68 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43562  predicted protein  36.26 
 
 
180 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1631  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  28.71 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.591032  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  32.63 
 
 
125 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  34.65 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  51.61 
 
 
216 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  40 
 
 
215 aa  40.8  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2207  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  34.31 
 
 
159 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  32.14 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>