49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0987 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  100 
 
 
124 aa  259  6e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  44.35 
 
 
126 aa  105  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  42.98 
 
 
128 aa  100  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  41.94 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  43.33 
 
 
128 aa  97.1  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  40.65 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  39.52 
 
 
124 aa  93.6  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  40.65 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  40.8 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  43.96 
 
 
125 aa  80.1  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  45.65 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  35.54 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  36.29 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  44.94 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  40.22 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  36.59 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  35.29 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  34.15 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  42.86 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  37.7 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  33.33 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  34.92 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  37.3 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  35.48 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  33.06 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  43.82 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  30.58 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  34.12 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  33.33 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  33.6 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  31.97 
 
 
124 aa  60.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  28.8 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  26.35 
 
 
187 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  37.5 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  37.35 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  36.36 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  26.79 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.48 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  26.32 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  30.09 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  26.61 
 
 
118 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  26.85 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1362  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.07 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395894  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  31.37 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  34.95 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  27.56 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  25.69 
 
 
118 aa  40.8  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>