20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1362 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1362  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  100 
 
 
120 aa  249  1e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395894  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  54.03 
 
 
124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  48.03 
 
 
129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  52.14 
 
 
115 aa  127  6e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  51.59 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  47.97 
 
 
131 aa  120  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  47.97 
 
 
131 aa  120  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1631  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  42.61 
 
 
117 aa  97.4  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.591032  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  43.48 
 
 
118 aa  94.7  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  41.28 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  39.42 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1257  hypothetical protein  28.7 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.537456  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2950  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  34.09 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000142476  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.07 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  34.58 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.58 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1185  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  25.49 
 
 
130 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  31.43 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  29.57 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  29.46 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>