62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2870 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  100 
 
 
126 aa  266  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  69.6 
 
 
126 aa  192  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  68.8 
 
 
126 aa  190  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  69.35 
 
 
126 aa  187  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  68 
 
 
126 aa  185  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  67.74 
 
 
124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  68.55 
 
 
124 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  65.08 
 
 
126 aa  180  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  64.8 
 
 
126 aa  180  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  67.2 
 
 
126 aa  180  8.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  64 
 
 
126 aa  178  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  68 
 
 
125 aa  178  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  64 
 
 
125 aa  176  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  63.64 
 
 
126 aa  175  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  67.72 
 
 
127 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  63.71 
 
 
124 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  63.71 
 
 
124 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  59.2 
 
 
125 aa  161  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  58.4 
 
 
126 aa  156  9e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  55.74 
 
 
126 aa  152  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  59.2 
 
 
125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  56.45 
 
 
131 aa  146  9e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  55.56 
 
 
131 aa  144  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  53.28 
 
 
126 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  49.59 
 
 
127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  44.88 
 
 
127 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  47.58 
 
 
126 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  47.5 
 
 
124 aa  114  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  40.48 
 
 
128 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  44.35 
 
 
126 aa  103  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  44.35 
 
 
126 aa  103  8e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  40.16 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  41.28 
 
 
121 aa  93.6  9e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  41.13 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  45.65 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  27.7 
 
 
187 aa  60.8  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  36.11 
 
 
181 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  37.04 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  32.52 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  37.11 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1636  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  46.81 
 
 
47 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  38.38 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  34.21 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  31.71 
 
 
161 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  36.08 
 
 
118 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0162  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  57.58 
 
 
38 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  36.08 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  32.17 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  32.48 
 
 
131 aa  44.3  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  32.48 
 
 
131 aa  44.3  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  50 
 
 
41 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  48.65 
 
 
214 aa  43.9  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 
200 aa  43.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0079  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  55.88 
 
 
42 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  33.68 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.02 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  34 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.35 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  44.44 
 
 
41 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  48.57 
 
 
55 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  48.57 
 
 
55 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  48.57 
 
 
55 aa  40  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>