63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0204 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  100 
 
 		 126 aa  258  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  86.29 
 
 		 124 aa  230  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  77.6 
 
 		 126 aa  203  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  75.2 
 
 		 126 aa  201  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  74.6 
 
 		 126 aa  201  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  68 
 
 		 126 aa  185  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  68.8 
 
 		 126 aa  184  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  65.87 
 
 		 126 aa  179  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  65.08 
 
 		 126 aa  175  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  65.08 
 
 		 127 aa  168  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  62.7 
 
 		 126 aa  166  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  64 
 
 		 125 aa  164  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  64 
 
 		 126 aa  164  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  58.87 
 
 		 126 aa  164  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  62.4 
 
 		 125 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  59.68 
 
 		 124 aa  160  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  58.87 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  60 
 
 		 125 aa  158  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  59.68 
 
 		 124 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  59.84 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  62.18 
 
 		 125 aa  151  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  58.2 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  56.35 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  53.54 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  52.03 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  49.19 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  45.97 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  50 
 
 		 124 aa  114  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  41.27 
 
 		 128 aa  104  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  45.08 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  45.9 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  46.43 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  46.74 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  41.8 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  42.86 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.33 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  37.96 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  71.88 
 
 		 216 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  38.1 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1636  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  48.94 
 
 		 47 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  50 
 
 		 215 aa  51.2  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  35.05 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  55 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  37.04 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  36.11 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  36.11 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  34.86 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  64.52 
 
 		 41 aa  47.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0079  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  56.41 
 
 		 42 aa  47.4  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.19 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  64.52 
 
 		 41 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  58.82 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  58.82 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  34.02 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  58.82 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  62.5 
 
 		 215 aa  46.2  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0305  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  58.06 
 
 		 41 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.673126 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 200 aa  43.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  32.76 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1284  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  54.55 
 
 		 55 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.1144  normal  0.0192641 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  31.3 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  31.3 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.29 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>