58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0880 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  100 
 
 
115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  57.6 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1362  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  52.14 
 
 
120 aa  127  6e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  58.97 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  48 
 
 
129 aa  122  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  51.75 
 
 
124 aa  120  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  45.9 
 
 
131 aa  108  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  45.9 
 
 
131 aa  108  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1631  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  46.02 
 
 
117 aa  98.6  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.591032  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  48.6 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  39.45 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  34.23 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  33.33 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  36.27 
 
 
125 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  37.96 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  40.78 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  38.83 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  38.24 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  36.61 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1257  hypothetical protein  34.29 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.537456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  37.14 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  37.82 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.45 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  36.89 
 
 
126 aa  53.5  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  35.64 
 
 
125 aa  52.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  37.04 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  38.1 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  40.2 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  35.85 
 
 
128 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  35.04 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  37.27 
 
 
160 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  31.25 
 
 
126 aa  50.1  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  34.55 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  37.5 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  37.25 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.77 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  35.24 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  34.91 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  36.27 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  34.86 
 
 
124 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  37.5 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.33 
 
 
121 aa  47.8  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  35.29 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0990  hypothetical protein  29.13 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.2 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  30.19 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.51 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  36.45 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  32.56 
 
 
181 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2950  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  29.81 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000142476  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  33.33 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  33.33 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  38 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1185  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  28.3 
 
 
130 aa  41.2  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  37.11 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  34.91 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.84 
 
 
187 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>