19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1257 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1257  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  280  4.0000000000000003e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.537456  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1185  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  59.38 
 
 
130 aa  163  9e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2950  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  55.47 
 
 
130 aa  160  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000142476  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0990  hypothetical protein  52.38 
 
 
128 aa  159  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.29 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  29.36 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  28.83 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1362  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  28.7 
 
 
120 aa  50.4  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  32.43 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  32.43 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.08 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  27.93 
 
 
124 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.13 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  29.17 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  28.18 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  26.88 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1631  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  26.21 
 
 
117 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.591032  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  32.65 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  29.17 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>