37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1830 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  100 
 
 
125 aa  256  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  47.66 
 
 
118 aa  96.3  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  40.46 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1631  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  41.51 
 
 
117 aa  87  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.591032  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  39.53 
 
 
130 aa  84.7  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  38.24 
 
 
131 aa  84  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  38.24 
 
 
131 aa  84  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  39.45 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  36.21 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  31.71 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  37.27 
 
 
161 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1362  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  39.42 
 
 
120 aa  61.2  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  33.64 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2207  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  34.23 
 
 
159 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.33 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  37.84 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  35.14 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2950  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  29.29 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000142476  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  39.08 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  31.3 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.23 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1185  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  26 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  27.74 
 
 
181 aa  44.7  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.43 
 
 
118 aa  42.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  29.91 
 
 
126 aa  42.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  30 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  34.74 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  33.68 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  34.41 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  34.31 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.91 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  32.63 
 
 
125 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0990  hypothetical protein  27.62 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  34.41 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  31.68 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  34.41 
 
 
124 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  32.65 
 
 
126 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>