44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0271 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  100 
 
 		 131 aa  268  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  100 
 
 		 131 aa  268  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  56.15 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  57.36 
 
 		 129 aa  157  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  53.49 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  51.94 
 
 		 118 aa  140  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1631  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  52.76 
 
 		 117 aa  133  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.591032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1362  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  47.97 
 
 		 120 aa  120  9e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395894  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  45.9 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  38.24 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  34.59 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  33.09 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2950  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  31.19 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000142476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  36.52 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  30.33 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1257  hypothetical protein  32.43 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.537456  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  33.33 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  30.83 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1185  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.09 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  30.33 
 
 		 160 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  29.91 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  35.65 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  33.91 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  33.91 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  30.58 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  31.62 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  32.48 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  31.62 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  30.7 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2207  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  30.33 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  32.46 
 
 		 125 aa  42.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0990  hypothetical protein  23.42 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  33.91 
 
 		 127 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.93 
 
 		 187 aa  41.6  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  33.05 
 
 		 126 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  31.3 
 
 		 126 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.4 
 
 		 118 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  27.64 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.58 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  32.46 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  35.34 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  30.89 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  31.3 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  30.43 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>