63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0956 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  100 
 
 		 124 aa  257  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  96.77 
 
 		 124 aa  249  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  70.97 
 
 		 126 aa  197  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  66.94 
 
 		 126 aa  181  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  66.13 
 
 		 126 aa  179  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  65.32 
 
 		 126 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  63.71 
 
 		 126 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  63.71 
 
 		 126 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  62.6 
 
 		 126 aa  169  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  60.48 
 
 		 124 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  62.4 
 
 		 127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  60.48 
 
 		 124 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  57.26 
 
 		 126 aa  160  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  62.39 
 
 		 125 aa  159  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  58.87 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  59.2 
 
 		 125 aa  159  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  57.26 
 
 		 125 aa  155  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  55.65 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  56.45 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  53.17 
 
 		 131 aa  147  6e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  55.28 
 
 		 126 aa  147  7e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  54.84 
 
 		 131 aa  140  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  52.8 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  52.85 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  50.41 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  53.66 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  49.18 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  44.26 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  43.9 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  37.3 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  41.49 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  35.71 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  39.17 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  38.53 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  37.5 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.89 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  28.07 
 
 		 198 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  32.29 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  66.67 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  54.05 
 
 		 41 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0305  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  54.55 
 
 		 41 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.673126 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  33.91 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0079  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  58.82 
 
 		 42 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  33.91 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.33 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  51.52 
 
 		 41 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1636  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  45.24 
 
 		 47 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  30.63 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  35.71 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.61 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  28.83 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  45 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  28.42 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.35 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  33.63 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  62.07 
 
 		 55 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  62.07 
 
 		 55 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.73 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1576  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  58.33 
 
 		 39 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.154882  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  62.07 
 
 		 55 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  34.41 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>