24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2207 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2207  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  100 
 
 
159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  70 
 
 
161 aa  236  8e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  69.18 
 
 
160 aa  225  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  35.51 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.78 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.05 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  32.71 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.91 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.41 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  34.23 
 
 
125 aa  57.4  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  36.94 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1185  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.6 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2950  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  34.4 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000142476  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0990  hypothetical protein  29.06 
 
 
128 aa  52  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  33.61 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1631  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.86 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.591032  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  30.33 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  30.33 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.53 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  31 
 
 
127 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  29.84 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2856  hypothetical protein  27.35 
 
 
280 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.967749  normal  0.0104603 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  34.31 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  34.38 
 
 
131 aa  40.8  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>