74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0945 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  100 
 
 
131 aa  272  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  58.06 
 
 
125 aa  157  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  60.48 
 
 
124 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  60.48 
 
 
127 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  58.73 
 
 
126 aa  149  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  58.73 
 
 
125 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  57.6 
 
 
126 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  55.56 
 
 
126 aa  144  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  56.35 
 
 
126 aa  141  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  54.55 
 
 
126 aa  140  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  54.84 
 
 
124 aa  140  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  55.12 
 
 
126 aa  140  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  56.35 
 
 
125 aa  140  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  54.76 
 
 
125 aa  140  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  54.84 
 
 
124 aa  140  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  56.45 
 
 
124 aa  136  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  51.52 
 
 
131 aa  135  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  56.1 
 
 
126 aa  135  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  53.54 
 
 
126 aa  134  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  49.21 
 
 
127 aa  134  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  53.28 
 
 
126 aa  134  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  53.23 
 
 
126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  54.92 
 
 
126 aa  133  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  53.66 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  49.14 
 
 
126 aa  121  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  48.41 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  47.9 
 
 
124 aa  118  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  47.58 
 
 
127 aa  117  6e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  39.2 
 
 
128 aa  97.8  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  39.17 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  40.34 
 
 
126 aa  84  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  43.01 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  39.34 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  33.04 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.06 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  43.82 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.41 
 
 
187 aa  60.5  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  37.96 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.68 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  34.19 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  30.53 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.47 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0305  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  52.78 
 
 
41 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.673126 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.3 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  38.54 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  29.91 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.92 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  55.56 
 
 
41 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2226  hypothetical protein  36.71 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0079  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  55.88 
 
 
42 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  54.55 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  54.55 
 
 
55 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43562  predicted protein  32.04 
 
 
180 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  55.88 
 
 
216 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  54.55 
 
 
55 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1636  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  50 
 
 
47 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  28.87 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  48.78 
 
 
215 aa  45.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  35.42 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1576  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  57.58 
 
 
39 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.154882  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 
200 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  58.06 
 
 
41 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  31.62 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  31.62 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  34.31 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  52.94 
 
 
215 aa  43.5  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  34.74 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  48.57 
 
 
214 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  30.7 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1362  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.43 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395894  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1631  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.69 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.591032  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  28.21 
 
 
197 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2207  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  34.38 
 
 
159 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  26.23 
 
 
198 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>