38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1006 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  100 
 
 
120 aa  246  7e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  42.02 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  37.59 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  48.6 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  40.31 
 
 
129 aa  77  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1631  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  38.66 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.591032  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  37.9 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1362  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  41.28 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395894  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  34.59 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  34.59 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  31.71 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1257  hypothetical protein  28.83 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.537456  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  37.84 
 
 
128 aa  51.2  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.58 
 
 
187 aa  51.6  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  37.37 
 
 
131 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  35.51 
 
 
181 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  36.19 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  38 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  31.45 
 
 
160 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.69 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  32.14 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  34.31 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  37.76 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2950  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  26.17 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000142476  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  36.63 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  36 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  31.68 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  34.31 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.33 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1185  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  27.03 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  34.02 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  34.23 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  26.89 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2207  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  29.84 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  34.65 
 
 
125 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0990  hypothetical protein  26.36 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.95 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  34 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>