47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0430 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  100 
 
 
118 aa  244  4e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  93.22 
 
 
118 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  93.22 
 
 
118 aa  229  1e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  86.44 
 
 
118 aa  214  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  66.95 
 
 
118 aa  176  8e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  33.64 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  32.71 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2207  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  31.36 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  30.71 
 
 
181 aa  60.5  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  37.19 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0990  hypothetical protein  33.98 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  35.4 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.04 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  32.04 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  33.68 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  32.67 
 
 
126 aa  50.4  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  30.53 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  36.11 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  36.84 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  35.42 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  36.54 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  29.32 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  35.42 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  35.14 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  37.11 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1631  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.58 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.591032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  36.08 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2950  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  27.72 
 
 
130 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000142476  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  36.08 
 
 
126 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  36.08 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  35.42 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  34.02 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  27.2 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  30.58 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  30.19 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  30.58 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  26.61 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  31.18 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  30.63 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.91 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  28.42 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.58 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  32.61 
 
 
127 aa  42.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  30.63 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  30.53 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  33.68 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1185  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  23.15 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>