59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0613 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  100 
 
 		 126 aa  261  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  64 
 
 		 126 aa  169  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  57.38 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  58.2 
 
 		 124 aa  147  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  56.35 
 
 		 126 aa  146  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  57.38 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  57.14 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  54.92 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  51.97 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  56.35 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  53.28 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  52.8 
 
 		 125 aa  137  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  53.17 
 
 		 127 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  50 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  50.41 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  56.56 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  53.6 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  50.41 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  55.65 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  50 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  54.1 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  49.21 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  48.8 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  50.81 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  53.66 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  47.54 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  47.62 
 
 		 127 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  44 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  37.9 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  35.94 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  40.83 
 
 		 126 aa  92  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.25 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  35 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  35.77 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.58 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.92 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.23 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  36.63 
 
 		 181 aa  51.2  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0079  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  58.82 
 
 		 42 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  59.46 
 
 		 41 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  29.91 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  62.5 
 
 		 41 aa  47.8  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0162  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  58.82 
 
 		 38 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  30.84 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  37.76 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  36.11 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  53.12 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  53.12 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1636  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  55.17 
 
 		 47 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  30 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  53.12 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1631  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.82 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.591032  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 200 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  32.46 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  32.46 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  45.95 
 
 		 214 aa  40.4  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1362  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.46 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395894  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0305  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  47.22 
 
 		 41 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.673126 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  45.95 
 
 		 216 aa  40  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>