33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1636 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1636  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  100 
 
 		 47 aa  99.8  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  54.76 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  48.94 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  46.81 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  46.81 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  46.81 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  46.81 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1284  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  51.22 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.1144  normal  0.0192641 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  48.72 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  42.55 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  45.24 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  50 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  50 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  56.76 
 
 		 215 aa  46.2  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  48.57 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  47.62 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  38.3 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0079  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  50 
 
 		 42 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0305  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  60 
 
 		 41 aa  44.3  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.673126 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0162  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  58.06 
 
 		 38 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  46.34 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  50 
 
 		 41 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  45.24 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  51.43 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  51.43 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  55.17 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1576  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  60 
 
 		 39 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.154882  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  56.67 
 
 		 126 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  51.35 
 
 		 214 aa  41.6  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  48.65 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  51.61 
 
 		 41 aa  41.2  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  50 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  45 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>