26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1576 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1576  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  100 
 
 
39 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.154882  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  61.11 
 
 
55 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  61.11 
 
 
55 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  61.11 
 
 
55 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  60.61 
 
 
126 aa  47  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0079  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  63.33 
 
 
42 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0305  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  55.26 
 
 
41 aa  46.2  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.673126 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0162  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  54.05 
 
 
38 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  61.11 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  61.76 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  62.86 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  57.58 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  58.82 
 
 
127 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  56.41 
 
 
125 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  55.56 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  57.58 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  58.62 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1636  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  60 
 
 
47 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  54.55 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  54.29 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  54.05 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1284  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  52.78 
 
 
55 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.1144  normal  0.0192641 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  51.43 
 
 
41 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  58.33 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  51.43 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  58.33 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>