57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_05310 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  100 
 
 
127 aa  258  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  55.91 
 
 
126 aa  145  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  56 
 
 
126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  55.28 
 
 
126 aa  141  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  55.28 
 
 
125 aa  142  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  53.54 
 
 
127 aa  140  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  49.6 
 
 
125 aa  138  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  52 
 
 
126 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  54.84 
 
 
126 aa  138  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  52.85 
 
 
124 aa  137  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  50.81 
 
 
126 aa  135  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  52 
 
 
125 aa  135  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  53.6 
 
 
126 aa  135  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  49.21 
 
 
131 aa  134  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  50.81 
 
 
124 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  53.23 
 
 
124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  51.61 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  49.19 
 
 
124 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  50 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  47.24 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  49.19 
 
 
126 aa  127  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  49.19 
 
 
126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  47.24 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  46.83 
 
 
125 aa  123  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  44.88 
 
 
126 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  44.63 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  45.16 
 
 
127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  43.33 
 
 
126 aa  110  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  39.84 
 
 
128 aa  99.4  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  44.72 
 
 
126 aa  99  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  41.88 
 
 
126 aa  91.3  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  41.05 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  35.71 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  37.5 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  33.61 
 
 
200 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  28.8 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  31.62 
 
 
198 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  57.14 
 
 
55 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  57.14 
 
 
55 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  35.42 
 
 
181 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  54.29 
 
 
55 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  24.36 
 
 
187 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.38 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.19 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1576  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  62.86 
 
 
39 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.154882  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.19 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  30.19 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.91 
 
 
118 aa  43.5  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  30.89 
 
 
272 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  27.05 
 
 
197 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  65.52 
 
 
41 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  30.3 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  51.35 
 
 
214 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.85 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  33.63 
 
 
216 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  65.52 
 
 
41 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0305  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  55.88 
 
 
41 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.673126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>