56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2085 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  100 
 
 		 126 aa  261  3e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  64 
 
 		 126 aa  169  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  58.4 
 
 		 126 aa  157  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  60.66 
 
 		 125 aa  154  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  55.74 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  57.38 
 
 		 124 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  56 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  54.76 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  56.1 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  58.2 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  56.56 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  54.92 
 
 		 124 aa  147  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  55.28 
 
 		 124 aa  147  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  53.33 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  55.91 
 
 		 127 aa  145  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  54.47 
 
 		 125 aa  143  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  54.33 
 
 		 131 aa  143  9e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  57.14 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  54.92 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  55.12 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  57.26 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  54.1 
 
 		 126 aa  140  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  50.82 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  56.1 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  50.39 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  50.82 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  47.58 
 
 		 124 aa  117  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  40.32 
 
 		 128 aa  103  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  40.34 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  37.9 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  39.17 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  33.59 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  39.77 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  35.83 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.29 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.12 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  40.45 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.25 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0079  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  55.88 
 
 		 42 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  59.38 
 
 		 41 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  45.24 
 
 		 55 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  45.24 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1576  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  61.76 
 
 		 39 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.154882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  25.44 
 
 		 198 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  45.24 
 
 		 55 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  54.55 
 
 		 41 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  32.17 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  26.42 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  50 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  51.52 
 
 		 216 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0305  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  44.74 
 
 		 41 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.673126 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  30.89 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.85 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  30.89 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.31 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>