57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1924 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  100 
 
 		 128 aa  264  4e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  53.72 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  46.03 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  49.6 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  47.97 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  47.2 
 
 		 125 aa  120  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  45.24 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  45.24 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  45.31 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  45.6 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  42.06 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  41.27 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  41.73 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  40.48 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  40.48 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  42.02 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  41.27 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  41.41 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  42.06 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  43.2 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  40.32 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  42.06 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  38.89 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  45.45 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  41.6 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  42.02 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  39.84 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  37.3 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  53.26 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  39.2 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  43.33 
 
 		 124 aa  97.1  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  40.62 
 
 		 131 aa  96.7  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  39.2 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  37.9 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  28.21 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  28.69 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.45 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.74 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  32.5 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.95 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 200 aa  47  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  31.71 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  34.69 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  31.3 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43562  predicted protein  32.22 
 
 		 180 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.63 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  31.58 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  28.46 
 
 		 197 aa  42.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.68 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  28.1 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  32.22 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  31 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  31.91 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  27.64 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  27.64 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.53 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  26.13 
 
 		 124 aa  40  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>