48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0720 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  100 
 
 		 160 aa  328  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  83.23 
 
 		 161 aa  280  9e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2207  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  69.18 
 
 		 159 aa  225  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  40.37 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.2 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  33.64 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.96 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.58 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.71 
 
 		 118 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  42.31 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  35.83 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  33.64 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  39.6 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  34.11 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  38.38 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0990  hypothetical protein  33.88 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  32.52 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  30.43 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  37.89 
 
 		 126 aa  50.8  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  37.27 
 
 		 115 aa  50.8  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  35.79 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  36.08 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2950  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  29.37 
 
 		 130 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000142476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  37.25 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  35.05 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  33.33 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  38.54 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  34.02 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1631  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.91 
 
 		 117 aa  48.5  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.591032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  32.29 
 
 		 124 aa  48.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  38.14 
 
 		 126 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  31.45 
 
 		 120 aa  47.8  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  30.33 
 
 		 131 aa  47.8  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  30.33 
 
 		 131 aa  47.8  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1185  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.33 
 
 		 130 aa  47.4  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  35 
 
 		 126 aa  47.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2226  hypothetical protein  27.67 
 
 		 132 aa  45.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  35.42 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  31.65 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  34.38 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  30.3 
 
 		 127 aa  43.9  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  29.82 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  32.38 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  34.74 
 
 		 126 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  33.33 
 
 		 125 aa  42.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  32.43 
 
 		 126 aa  42.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  34.41 
 
 		 126 aa  41.2  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>