50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0897 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  100 
 
 		 121 aa  247  3e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  45.24 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  48 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  54.35 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  53.26 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  40.65 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  47.25 
 
 		 127 aa  94.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  41.28 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  41.18 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  40.83 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  38.98 
 
 		 126 aa  92  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  43.82 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  50 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  38.52 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  44.57 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  46.74 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  47.83 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  44.86 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  41.49 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  46.24 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  41.05 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  41.49 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  42.39 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  47.87 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  43.48 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  45.24 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  45.35 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  40 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  43.01 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  35.25 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  39.77 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  38.89 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  44.09 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  39.56 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  32.91 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.46 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  42.05 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  38.38 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43562  predicted protein  30.7 
 
 		 180 aa  50.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  31.71 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.45 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.33 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  35.35 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  33.33 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.91 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.85 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  31.91 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.73 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1362  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.58 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>