30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1631 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1631  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  100 
 
 
117 aa  237  4e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.591032  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  59.48 
 
 
118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  52.76 
 
 
131 aa  133  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  52.76 
 
 
131 aa  133  8e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  47.5 
 
 
124 aa  110  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  45.08 
 
 
130 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  46.02 
 
 
115 aa  98.6  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1362  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  42.61 
 
 
120 aa  97.4  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395894  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  39.37 
 
 
129 aa  91.7  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  41.51 
 
 
125 aa  87  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  38.66 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2950  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  30.39 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000142476  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  32.73 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.48 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1185  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  26.92 
 
 
130 aa  50.8  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.9 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  30.91 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  38.68 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  31.58 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  27.27 
 
 
181 aa  47.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0990  hypothetical protein  27.88 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.7 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.73 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2207  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  31.86 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  28.71 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  31.82 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1257  hypothetical protein  26.21 
 
 
134 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.537456  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  32.69 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  32.69 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  32.69 
 
 
125 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>