58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0978 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0978  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 126 aa  257  4e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0860  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 126 aa  257  4e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02998  transcriptional regulator PbsX family  64.52 
 
 		 125 aa  157  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 380 aa  55.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  42.19 
 
 		 459 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  39.71 
 
 		 243 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  37.33 
 
 		 235 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  31.43 
 
 		 210 aa  50.4  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  31.3 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  38.24 
 
 		 240 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  38.24 
 
 		 240 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 334 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2653  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200481  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  31.65 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  36.76 
 
 		 216 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  37.5 
 
 		 229 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  36.76 
 
 		 216 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2801  transcriptional regulators  33.72 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  37.5 
 
 		 229 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  37.88 
 
 		 259 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  40 
 
 		 328 aa  43.5  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  35.29 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  36.07 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  36.36 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  39.68 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 296 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  33.78 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1627  transcriptional regulator, XRE family  31.63 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  31.03 
 
 		 263 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  36.36 
 
 		 251 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  35.38 
 
 		 243 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  34.78 
 
 		 216 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  36.76 
 
 		 207 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  35.94 
 
 		 229 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 163 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  32.14 
 
 		 217 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  32.81 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0163  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  31.75 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  38.33 
 
 		 262 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  38.36 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 203 aa  40.8  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 229 aa  40.4  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  40 
 
 		 244 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  38.33 
 
 		 262 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  38.33 
 
 		 262 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 262 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  26.72 
 
 		 270 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 185 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>