28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2394 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2394  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 		 283 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3398  putative phage repressor  47.18 
 
 		 280 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0077186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  41.95 
 
 		 273 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3772  putative phage repressor  35.87 
 
 		 289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0262025  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2131  putative phage repressor  42.71 
 
 		 289 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131906  hitchhiker  0.000000754842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1991  putative phage repressor  35.51 
 
 		 289 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000855833  hitchhiker  0.0000527672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  36.48 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1508  Rac prophage repressor  50 
 
 		 158 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.857807  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2287  prophage repressor  53.33 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.123872  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  30.92 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  29.93 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  36.51 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  28.68 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  29.84 
 
 		 240 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  27.46 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  30.92 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  30.92 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  31.5 
 
 		 219 aa  50.8  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  31.29 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  33.75 
 
 		 144 aa  49.3  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1166  phage-related repressor protein  26.06 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000408495  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 240 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  31.43 
 
 		 216 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  29.5 
 
 		 230 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  27.64 
 
 		 219 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  26.12 
 
 		 227 aa  42.7  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  25.66 
 
 		 269 aa  42.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>