35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2836 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2836  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  100 
 
 
236 aa  471  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0838943  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  29.46 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  34.95 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3151  Repressor lexA  33.07 
 
 
154 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.662921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3152  LexA repressor  31.65 
 
 
205 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1475  LexA repressor  33.12 
 
 
211 aa  48.5  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.457406 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  31.85 
 
 
815 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  31.34 
 
 
229 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  30.89 
 
 
264 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.48 
 
 
231 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0696  putative prophage repressor  26.87 
 
 
157 aa  45.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00336277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00150  LexA repressor  30.82 
 
 
213 aa  45.4  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  38.24 
 
 
145 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  29.07 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.44 
 
 
207 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  40.45 
 
 
207 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2792  LexA repressor  30.86 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147289  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  34.18 
 
 
139 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.46 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  37.65 
 
 
226 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0085  LexA repressor  32 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00110389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02088  LexA repressor  36.9 
 
 
201 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  38.64 
 
 
207 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3565  LexA repressor  36 
 
 
224 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173958  hitchhiker  0.00714221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  24.46 
 
 
207 aa  42.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  29.51 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2520  LexA repressor  30 
 
 
205 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0774546  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0099  LexA repressor  32 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1234  putative prophage repressor  25.55 
 
 
153 aa  42.4  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000530915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  31.09 
 
 
232 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.33 
 
 
228 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  37.33 
 
 
230 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2425  LexA repressor  31.16 
 
 
205 aa  42  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  34.11 
 
 
230 aa  42  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.33 
 
 
229 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>