18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2803 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2803  bacteriophage CI repressor  100 
 
 		 155 aa  314  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10438  transcriptional regulator, putative  48.37 
 
 		 147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1905  HTH_3 family transcriptional regulator protein  39.51 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1708  transcriptional regulator  35.17 
 
 		 231 aa  91.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0192115  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2000  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221845  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1044  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329411  normal  0.26776 
 
 
-
 
NC_002950  PG1063  transcriptional regulator, putative  27.88 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.150252 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2433  hypothetical protein  27.91 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4185  hypothetical protein  38.1 
 
 		 122 aa  48.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.373535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0868  putative phage repressor  31.73 
 
 		 244 aa  47  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000901562  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1673  hypothetical protein  28.77 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  28.38 
 
 		 235 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5589  putative phage repressor  30.88 
 
 		 237 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2393  helix-turn-helix domain protein  34.85 
 
 		 306 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  32.81 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5549  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 232 aa  40.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.361846  hitchhiker  0.00439273 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  27.5 
 
 		 242 aa  40.4  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>