22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10438 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10438  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 147 aa  300  4.0000000000000003e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2803  bacteriophage CI repressor  47.77 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1905  HTH_3 family transcriptional regulator protein  42 
 
 		 148 aa  116  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1708  transcriptional regulator  50.77 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0192115  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1044  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329411  normal  0.26776 
 
 
-
 
NC_002950  PG1063  transcriptional regulator, putative  28.19 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.150252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2000  transcriptional regulator, XRE family  30.18 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221845  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0270  hypothetical protein  34.15 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0868  putative phage repressor  34.12 
 
 		 244 aa  45.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000901562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  28.79 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4185  hypothetical protein  31.34 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.373535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 212 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  36.73 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>