39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_264 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_264  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  154  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2500  XRE family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 69 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0746  transcriptional regulator, XRE family  56 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.376996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4734  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.154831 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0387  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000537599 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3947  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  48.21 
 
 		 610 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3774  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0502189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4414  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.514306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3770  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 81 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3627  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1799  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  51.35 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0921  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.451921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4293  transcriptional regulator, XRE family  44.19 
 
 		 239 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  46.34 
 
 		 369 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  48.65 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 374 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1246  transcriptional regulator-like protein  37.04 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0697  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 374 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4058  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326996  normal  0.47831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4109  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3986  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4004  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4174  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5367  transcriptional regulator, XRE family  48.72 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.216549 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  48.65 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2627  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0561718 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3694  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.516749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3398  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1854  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0304  XRE family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  45.95 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  45.95 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1608  hypothetical protein  35.48 
 
 		 375 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1089  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 258 aa  40  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>