40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2500 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2500  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 69 aa  141  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_264  hypothetical protein  51.47 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0746  transcriptional regulator, XRE family  55.56 
 
 		 64 aa  67  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.376996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0387  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000537599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4734  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.154831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3770  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4414  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.514306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3774  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0502189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5367  transcriptional regulator, XRE family  52.08 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.216549 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3947  transcriptional regulator, XRE family  53.49 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1799  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  37.1 
 
 		 610 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  51.28 
 
 		 459 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  42.5 
 
 		 277 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  45 
 
 		 328 aa  45.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3627  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 273 aa  43.9  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 327 aa  43.5  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  38.78 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  48.72 
 
 		 380 aa  42.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  41.86 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  46.34 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 183 aa  42  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2141  helix-turn-helix domain protein  41.86 
 
 		 82 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4293  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 239 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  41.86 
 
 		 152 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  42.86 
 
 		 231 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  32.79 
 
 		 425 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  47.37 
 
 		 194 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  41.46 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0587  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 1381 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0434088  hitchhiker  0.00000000000000216733 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  41.46 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1020  transcriptional regulator, XRE family  43.9 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2366  hypothetical protein  32.65 
 
 		 502 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0463588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 374 aa  40.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1462  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 114 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>