42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1065 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1065  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  343  6e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  0.845779 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3364  hypothetical protein  36 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1009  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1151  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 110 aa  70.5  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.736435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1261  helix-turn-helix domain-containing protein  29.81 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2307  hypothetical protein  28.67 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2216  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0015344  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4148  XRE family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0797664 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3859  hypothetical protein  28.93 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.632136  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0889  putative transcriptional regulator  28.93 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2731  XRE family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1619  hypothetical protein  35.38 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5296  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 103 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  28.1 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209704  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1840  transcriptional regulator, XRE family  28.1 
 
 		 131 aa  45.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4414  transcriptional regulator, XRE family  43.18 
 
 		 99 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.514306 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4076  helix-turn-helix domain-containing protein  32.14 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4734  XRE family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 82 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.154831 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4931  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 		 96 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.724146 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03356  hypothetical protein  36.23 
 
 		 96 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3876  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 		 96 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0161  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 		 96 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0157  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 96 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4051  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 		 96 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03405  predicted transcriptional regulator  36.23 
 
 		 96 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  42.59 
 
 		 201 aa  44.3  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.425253  normal  0.20556 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3756  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 		 96 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3528  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 133 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3445  helix-turn-helix domain-containing protein  31.43 
 
 		 335 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3971  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 96 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2110  hypothetical protein  30.38 
 
 		 531 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0845  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 131 aa  43.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0317  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 103 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0550269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3627  transcriptional regulator, XRE family  36.73 
 
 		 87 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0746  transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 		 64 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.376996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1337  transcriptional regulator, XRE family  29.09 
 
 		 136 aa  42  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1020  transcriptional regulator, XRE family  32.29 
 
 		 103 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3776  XRE family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 133 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0530  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 181 aa  41.2  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1375  XRE family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 136 aa  41.6  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0164  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 92 aa  41.2  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0720  hypothetical protein  36.92 
 
 		 89 aa  40.8  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.719881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>