33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2307 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2307  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1410  hypothetical protein  38.17 
 
 		 168 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  34.09 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1441  hypothetical protein  32.26 
 
 		 137 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3776  XRE family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3528  XRE family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1065  XRE family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  0.845779 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4193  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990489  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4204  Cro/CI family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1649  helix-turn-helix domain-containing protein  32.08 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1536  XRE family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 133 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.116016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1988  transcriptional regulator, XRE family  35.83 
 
 		 132 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4148  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 155 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0797664 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1840  transcriptional regulator, XRE family  31 
 
 		 131 aa  53.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1316  hypothetical protein  31.58 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000132332  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  26.47 
 
 		 334 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0845  XRE family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 131 aa  50.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02893  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.78 
 
 		 131 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.436146  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3199  Cro/CI family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 131 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02843  hypothetical protein  27.78 
 
 		 131 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1375  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 136 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0679  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 		 131 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0676  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 131 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.269723 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1337  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 136 aa  49.7  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4634  helix-turn-helix domain-containing protein  30.39 
 
 		 133 aa  48.5  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0363  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 133 aa  48.1  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5547  XRE family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 133 aa  48.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.273905 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3859  hypothetical protein  30.23 
 
 		 132 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.632136  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0889  putative transcriptional regulator  30.23 
 
 		 132 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2210  XRE family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.752058  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1215  helix-turn-helix domain-containing protein  27.62 
 
 		 339 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  23 
 
 		 334 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  21.21 
 
 		 333 aa  41.6  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>