35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1441 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1441  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  283  5.999999999999999e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4657  XRE family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  35.56 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209704  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0679  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02843  hypothetical protein  33.82 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0676  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.269723 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3199  Cro/CI family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02893  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.82 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.436146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1410  hypothetical protein  35.9 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117537  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3528  XRE family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1536  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.116016 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3859  hypothetical protein  33.83 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.632136  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0889  putative transcriptional regulator  33.83 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4193  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1649  helix-turn-helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4204  Cro/CI family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1840  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3776  XRE family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1988  transcriptional regulator, XRE family  34.71 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4148  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0797664 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4634  helix-turn-helix domain-containing protein  32.56 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0363  XRE family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2210  XRE family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.752058  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0845  XRE family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2307  hypothetical protein  32.26 
 
 		 204 aa  57  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133913 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1337  transcriptional regulator, XRE family  35.07 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1375  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5547  XRE family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.273905 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 333 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0530  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 181 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2211  hypothetical protein  30.6 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.371896  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1316  hypothetical protein  26.05 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000132332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4861  transcriptional regulator, XRE family  28.8 
 
 		 333 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000181011  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1215  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 339 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1282  putative DNA-binding protein  36.99 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>