33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2210 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2210  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  321  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.752058  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2211  hypothetical protein  71.62 
 
 		 165 aa  214  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.371896  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3528  XRE family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0679  transcriptional regulator, XRE family  49.63 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02843  hypothetical protein  49.63 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0676  XRE family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.269723 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3199  Cro/CI family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02893  predicted DNA-binding transcriptional regulator  49.63 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.436146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3859  hypothetical protein  49.62 
 
 		 132 aa  130  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.632136  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0889  putative transcriptional regulator  49.62 
 
 		 132 aa  130  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0363  XRE family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 133 aa  130  6e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1536  XRE family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.116016 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4193  XRE family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 133 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3776  XRE family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 133 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5547  XRE family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 133 aa  120  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.273905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1649  helix-turn-helix domain-containing protein  45.86 
 
 		 133 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4204  Cro/CI family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 133 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4634  helix-turn-helix domain-containing protein  45.86 
 
 		 133 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1840  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  38.06 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209704  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0845  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 131 aa  88.2  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1988  transcriptional regulator, XRE family  38.17 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4148  XRE family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0797664 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1337  transcriptional regulator, XRE family  32.85 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1375  XRE family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4657  XRE family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1410  hypothetical protein  31.21 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1441  hypothetical protein  30.4 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1834  transcriptional regulator, XRE family  52.17 
 
 		 52 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  26.92 
 
 		 333 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2307  hypothetical protein  31.48 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133913 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1215  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 339 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0442  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.509401  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>