25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1215 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1215  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 339 aa  675    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  33.06 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  26.38 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2426  hypothetical protein  25.52 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0353  helix-turn-helix domain-containing protein  24.93 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.747888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  34.98 
 
 		 332 aa  96.3  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  39.26 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4861  transcriptional regulator, XRE family  25.42 
 
 		 333 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000181011  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2797  transcriptional regulator, XRE family  27.65 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983915 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  30.46 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1316  hypothetical protein  36.62 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000132332  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  27.34 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0057  transcriptional regulator, XRE family  23.27 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5326  helix-turn-helix domain-containing protein  22.41 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000585614  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0071  helix-turn-helix domain-containing protein  22.65 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0419  transcriptional regulator, XRE family  48.08 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000615648 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3487  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000017923  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  32.56 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0850  XRE family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 100 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.07607  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2307  hypothetical protein  27.62 
 
 		 204 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133913 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1996  hypothetical protein  26.67 
 
 		 186 aa  44.3  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1441  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4690  hypothetical protein  23.93 
 
 		 183 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2210  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 157 aa  43.1  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.752058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2500  hypothetical protein  34.88 
 
 		 211 aa  42.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000522324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>