23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0353 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0353  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 332 aa  690    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.747888  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2426  hypothetical protein  28.91 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  31.86 
 
 		 333 aa  145  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  28.61 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0057  transcriptional regulator, XRE family  34.1 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4861  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000181011  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5326  helix-turn-helix domain-containing protein  31.11 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000585614  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0071  helix-turn-helix domain-containing protein  32.63 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2797  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983915 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  27.42 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1215  helix-turn-helix domain-containing protein  24.93 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  23.17 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  22.42 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  24.05 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  25.73 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4690  hypothetical protein  30 
 
 		 183 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1410  hypothetical protein  30.6 
 
 		 168 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117537  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1316  hypothetical protein  29.37 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000132332  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0762  hypothetical protein  30.3 
 
 		 183 aa  50.4  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359066  normal  0.554709 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3487  hypothetical protein  31.33 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000017923  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3615  hypothetical protein  30 
 
 		 170 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3156  hypothetical protein  51.43 
 
 		 186 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1940  hypothetical protein  25.66 
 
 		 184 aa  43.1  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>