20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5326 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5326  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 328 aa  679    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000585614  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0071  helix-turn-helix domain-containing protein  40.48 
 
 		 335 aa  259  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0057  transcriptional regulator, XRE family  40.67 
 
 		 326 aa  252  7e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4861  transcriptional regulator, XRE family  42.69 
 
 		 333 aa  248  9e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000181011  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0353  helix-turn-helix domain-containing protein  31.11 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.747888  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2426  hypothetical protein  29.61 
 
 		 336 aa  119  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2797  transcriptional regulator, XRE family  31.05 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983915 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  26.37 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  27.78 
 
 		 334 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1215  helix-turn-helix domain-containing protein  22.41 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4690  hypothetical protein  31.65 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  28.44 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0762  hypothetical protein  31.96 
 
 		 183 aa  53.1  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359066  normal  0.554709 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1316  hypothetical protein  27.59 
 
 		 214 aa  49.7  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000132332  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  19.18 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  20.47 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1410  hypothetical protein  28.42 
 
 		 168 aa  46.2  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117537  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0419  transcriptional regulator, XRE family  42 
 
 		 189 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000615648 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0530  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 181 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4657  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 142 aa  42.7  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>