20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0071 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0071  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 335 aa  699    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0057  transcriptional regulator, XRE family  73.93 
 
 		 326 aa  513  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4861  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000181011  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5326  helix-turn-helix domain-containing protein  40.48 
 
 		 328 aa  259  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000585614  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  31.06 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  30.86 
 
 		 333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0353  helix-turn-helix domain-containing protein  32.63 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.747888  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2797  transcriptional regulator, XRE family  30.5 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983915 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2426  hypothetical protein  26.35 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1215  helix-turn-helix domain-containing protein  22.65 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4690  hypothetical protein  30.14 
 
 		 183 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  24.44 
 
 		 303 aa  53.5  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  22.26 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0419  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 189 aa  49.3  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000615648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  27.45 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1410  hypothetical protein  27.35 
 
 		 168 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  24.73 
 
 		 335 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0304  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 96 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0762  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  43.9  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359066  normal  0.554709 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1940  hypothetical protein  27.74 
 
 		 184 aa  43.5  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>