19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2426 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2426  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  704    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0353  helix-turn-helix domain-containing protein  28.91 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.747888  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  29.22 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  27.99 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  27.73 
 
 		 332 aa  119  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5326  helix-turn-helix domain-containing protein  29.61 
 
 		 328 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000585614  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2797  transcriptional regulator, XRE family  27.04 
 
 		 306 aa  116  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983915 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  25.32 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1215  helix-turn-helix domain-containing protein  25.52 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  23.82 
 
 		 335 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4861  transcriptional regulator, XRE family  28.3 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000181011  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0057  transcriptional regulator, XRE family  26.41 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0071  helix-turn-helix domain-containing protein  26.35 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3487  hypothetical protein  45.12 
 
 		 274 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000017923  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  24.81 
 
 		 303 aa  50.8  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0419  transcriptional regulator, XRE family  30.26 
 
 		 189 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000615648 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0762  hypothetical protein  27.94 
 
 		 183 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359066  normal  0.554709 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4690  hypothetical protein  24.43 
 
 		 183 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>