42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1643 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  100 
 
 		 332 aa  681    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  72.12 
 
 		 334 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  59.94 
 
 		 335 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  37.84 
 
 		 339 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  30.25 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2426  hypothetical protein  27.73 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3487  hypothetical protein  36.22 
 
 		 274 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000017923  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  25.53 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  24.83 
 
 		 303 aa  97.1  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1215  helix-turn-helix domain-containing protein  34.98 
 
 		 339 aa  96.3  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0353  helix-turn-helix domain-containing protein  22.42 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.747888  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0785  phage-associated protein  32.91 
 
 		 165 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  0.0707601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3910  prophage ps3 protein 01  33.81 
 
 		 163 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.453546  normal  0.140581 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0416  putative prophage protein (ps3)  32.68 
 
 		 153 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.727229  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0921  phage-associated protein  31.78 
 
 		 156 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.415452  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0101  putative prophage protein (ps3)  34.35 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0917  phage-associated protein  33.94 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1204  hypothetical protein  29.08 
 
 		 153 aa  67.4  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000807308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2529  hypothetical protein  29.17 
 
 		 150 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.396332 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0035  hypothetical protein  31.62 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.49607  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1211  CPW-WPC domain protein  29.08 
 
 		 153 aa  65.1  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101812 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0850  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre domain protein  30.47 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0493  hypothetical protein  30.47 
 
 		 131 aa  63.9  0.000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.754304  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2797  transcriptional regulator, XRE family  23.43 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983915 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2715  phage-associated protein-like  32.82 
 
 		 159 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1567  uncharacterized phage-associated protein  34.58 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1909  prophage ps3 protein 01  31.09 
 
 		 165 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.7495  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1287  Putative phage-associated protein  32.52 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4876  phage-associated protein  27.74 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136498  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4064  Uncharacterized phage-associated protein  28.7 
 
 		 164 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0057  transcriptional regulator, XRE family  20.57 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1323  hypothetical protein  26.13 
 
 		 161 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338891  hitchhiker  0.00835036 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0071  helix-turn-helix domain-containing protein  22.26 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1316  hypothetical protein  27.87 
 
 		 214 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000132332  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3930  hypothetical protein  25 
 
 		 174 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1410  hypothetical protein  31.58 
 
 		 168 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117537  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0895  phage-associated protein-like protein  33.63 
 
 		 173 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5326  helix-turn-helix domain-containing protein  20.47 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000585614  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4719  uncharacterized phage-associated protein-like protein  25.21 
 
 		 166 aa  46.2  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281895  normal  0.115987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4861  transcriptional regulator, XRE family  20.57 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000181011  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0419  transcriptional regulator, XRE family  28.77 
 
 		 189 aa  43.5  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000615648 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1421  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  43.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>