32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1204 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1204  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  323  6e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000807308 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1211  CPW-WPC domain protein  87.58 
 
 		 153 aa  285  1e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101812 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0850  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre domain protein  50 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2529  hypothetical protein  35.57 
 
 		 150 aa  91.7  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.396332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0785  phage-associated protein  37.67 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  0.0707601 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1567  uncharacterized phage-associated protein  36.69 
 
 		 196 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  32.06 
 
 		 339 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4064  Uncharacterized phage-associated protein  31.94 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0917  phage-associated protein  33.33 
 
 		 209 aa  77  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0921  phage-associated protein  30.57 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.415452  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4876  phage-associated protein  32.03 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136498  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1909  prophage ps3 protein 01  32 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.7495  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  31.06 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  29.08 
 
 		 332 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3910  prophage ps3 protein 01  28.57 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.453546  normal  0.140581 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0493  hypothetical protein  33.58 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.754304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  29.29 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0416  putative prophage protein (ps3)  29.8 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.727229  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1287  Putative phage-associated protein  32 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4719  uncharacterized phage-associated protein-like protein  25.62 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281895  normal  0.115987 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0101  putative prophage protein (ps3)  30.34 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1323  hypothetical protein  27.48 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338891  hitchhiker  0.00835036 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  29.05 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2715  phage-associated protein-like  29.06 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0035  hypothetical protein  27.03 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.49607  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0451  hypothetical protein  27.34 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3930  hypothetical protein  46.51 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4344  hypothetical protein  31.25 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.290178 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1996  hypothetical protein  29.66 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1421  hypothetical protein  38.78 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304499 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0895  phage-associated protein-like protein  23.48 
 
 		 173 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2017  phage-associated protein-like protein  25 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0122903  hitchhiker  0.00440161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>