23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1287 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1287  Putative phage-associated protein  100 
 
 
169 aa  341  2.9999999999999997e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1567  uncharacterized phage-associated protein  33.78 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0850  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre domain protein  34.59 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  35.48 
 
 
339 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1204  hypothetical protein  32 
 
 
153 aa  60.8  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000807308 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0921  phage-associated protein  26.39 
 
 
156 aa  58.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.415452  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  32.52 
 
 
332 aa  57.4  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1211  CPW-WPC domain protein  32.52 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101812 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3910  prophage ps3 protein 01  29.58 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.453546  normal  0.140581 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  32.56 
 
 
335 aa  53.9  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0035  hypothetical protein  31.06 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.49607  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0785  phage-associated protein  29.05 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  0.0707601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2529  hypothetical protein  27.46 
 
 
150 aa  51.6  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.396332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  26.83 
 
 
334 aa  50.8  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0416  putative prophage protein (ps3)  27.7 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.727229  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  29.66 
 
 
303 aa  48.1  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0493  hypothetical protein  31.53 
 
 
131 aa  47.4  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.754304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0917  phage-associated protein  25.62 
 
 
209 aa  45.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1323  hypothetical protein  24.81 
 
 
161 aa  44.7  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338891  hitchhiker  0.00835036 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0101  putative prophage protein (ps3)  28.38 
 
 
161 aa  44.3  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4064  Uncharacterized phage-associated protein  21.64 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3930  hypothetical protein  23.9 
 
 
174 aa  42  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0451  hypothetical protein  25.23 
 
 
183 aa  41.2  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>