29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0101 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0101  putative prophage protein (ps3)  100 
 
 
161 aa  340  5.999999999999999e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0416  putative prophage protein (ps3)  51.39 
 
 
153 aa  159  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.727229  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0493  hypothetical protein  49.61 
 
 
131 aa  128  3e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.754304  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0035  hypothetical protein  39.44 
 
 
157 aa  102  2e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.49607  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0785  phage-associated protein  36.96 
 
 
165 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  0.0707601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0921  phage-associated protein  29.45 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.415452  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  31.68 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  32.64 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2529  hypothetical protein  31.54 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.396332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  34.4 
 
 
334 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0850  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre domain protein  35.94 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3910  prophage ps3 protein 01  33.8 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.453546  normal  0.140581 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  34.35 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4876  phage-associated protein  30.2 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136498  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1567  uncharacterized phage-associated protein  30 
 
 
196 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4719  uncharacterized phage-associated protein-like protein  31.43 
 
 
166 aa  61.6  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281895  normal  0.115987 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1323  hypothetical protein  29.23 
 
 
161 aa  60.8  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338891  hitchhiker  0.00835036 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1204  hypothetical protein  30.34 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000807308 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1211  CPW-WPC domain protein  36.07 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101812 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4064  Uncharacterized phage-associated protein  28.17 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0917  phage-associated protein  26.81 
 
 
209 aa  57.8  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1909  prophage ps3 protein 01  28.93 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.7495  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0895  phage-associated protein-like protein  30.87 
 
 
173 aa  54.3  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  30.43 
 
 
303 aa  54.3  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2715  phage-associated protein-like  27.45 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3930  hypothetical protein  35.16 
 
 
174 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1287  Putative phage-associated protein  28.38 
 
 
169 aa  44.3  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1421  hypothetical protein  29.09 
 
 
188 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304499 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0451  hypothetical protein  28 
 
 
183 aa  42  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>