32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0785 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0785  phage-associated protein  100 
 
 
165 aa  342  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  0.0707601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3910  prophage ps3 protein 01  41.98 
 
 
163 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.453546  normal  0.140581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0921  phage-associated protein  39.44 
 
 
156 aa  115  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.415452  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0416  putative prophage protein (ps3)  37.06 
 
 
153 aa  91.3  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.727229  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1204  hypothetical protein  37.67 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000807308 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0101  putative prophage protein (ps3)  36.96 
 
 
161 aa  88.2  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0850  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre domain protein  34.97 
 
 
149 aa  85.5  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1211  CPW-WPC domain protein  36.55 
 
 
153 aa  84.7  5e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101812 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  32.91 
 
 
332 aa  82  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  30.6 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0035  hypothetical protein  31.72 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.49607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  32.7 
 
 
334 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0493  hypothetical protein  34.56 
 
 
131 aa  77  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.754304  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  30.99 
 
 
335 aa  75.1  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2529  hypothetical protein  32.88 
 
 
150 aa  73.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.396332 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  29.58 
 
 
303 aa  63.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1909  prophage ps3 protein 01  27.56 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.7495  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1567  uncharacterized phage-associated protein  29.13 
 
 
196 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0917  phage-associated protein  33.33 
 
 
209 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4064  Uncharacterized phage-associated protein  28.28 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4719  uncharacterized phage-associated protein-like protein  29.41 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281895  normal  0.115987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2715  phage-associated protein-like  28.87 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1287  Putative phage-associated protein  29.05 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0451  hypothetical protein  30.28 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3930  hypothetical protein  23.49 
 
 
174 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4876  phage-associated protein  27.21 
 
 
149 aa  48.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136498  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4344  hypothetical protein  29.6 
 
 
171 aa  48.1  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.290178 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1323  hypothetical protein  47.73 
 
 
161 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338891  hitchhiker  0.00835036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3156  hypothetical protein  36.99 
 
 
186 aa  45.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1421  hypothetical protein  42 
 
 
188 aa  44.3  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3399  hypothetical protein  38.33 
 
 
191 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0015092  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1224  hypothetical protein  33.8 
 
 
183 aa  41.6  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>