22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1421 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1421  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  386  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304499 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0451  hypothetical protein  53.85 
 
 		 183 aa  200  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0428  phage-associated protein-like protein  38.01 
 
 		 178 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0358952 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1323  hypothetical protein  34.03 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338891  hitchhiker  0.00835036 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3930  hypothetical protein  27.49 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0917  phage-associated protein  29.2 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4876  phage-associated protein  26.99 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2715  phage-associated protein-like  29.68 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0921  phage-associated protein  26.92 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.415452  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0895  phage-associated protein-like protein  28.48 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4719  uncharacterized phage-associated protein-like protein  27.7 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281895  normal  0.115987 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1211  CPW-WPC domain protein  25.5 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101812 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0850  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre domain protein  26.56 
 
 		 149 aa  48.5  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  29.46 
 
 		 339 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1567  uncharacterized phage-associated protein  30.83 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1204  hypothetical protein  38.78 
 
 		 153 aa  45.1  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000807308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0785  phage-associated protein  42 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  0.0707601 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  30 
 
 		 332 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3910  prophage ps3 protein 01  26.79 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.453546  normal  0.140581 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  25.58 
 
 		 335 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0101  putative prophage protein (ps3)  29.09 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03163  hypothetical protein  27.27 
 
 		 207 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414994  hitchhiker  0.00000000322947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>