14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3399 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3399  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0015092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0537  hypothetical protein  38.22 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.279957  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03163  hypothetical protein  44.97 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414994  hitchhiker  0.00000000322947 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0939  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  39.31 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0243141  normal  0.950925 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5705  hypothetical protein  31.25 
 
 		 225 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1996  hypothetical protein  33.94 
 
 		 186 aa  96.3  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3615  hypothetical protein  32 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9916  hypothetical protein  30.46 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1224  hypothetical protein  26.96 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3156  hypothetical protein  28.07 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  24.18 
 
 		 334 aa  45.1  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  25.86 
 
 		 303 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0785  phage-associated protein  38.33 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  0.0707601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3910  prophage ps3 protein 01  24.59 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.453546  normal  0.140581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>