39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0353 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  100 
 
 		 335 aa  680    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  59.88 
 
 		 334 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  59.94 
 
 		 332 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  34.35 
 
 		 339 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3487  hypothetical protein  33.98 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000017923  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2426  hypothetical protein  23.82 
 
 		 336 aa  104  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  28.8 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  25.61 
 
 		 303 aa  85.9  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3910  prophage ps3 protein 01  33.33 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.453546  normal  0.140581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0921  phage-associated protein  32.12 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.415452  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0101  putative prophage protein (ps3)  31.68 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0416  putative prophage protein (ps3)  34.59 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.727229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0785  phage-associated protein  30.99 
 
 		 165 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  0.0707601 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1215  helix-turn-helix domain-containing protein  27.34 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0493  hypothetical protein  30.47 
 
 		 131 aa  73.9  0.000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.754304  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0850  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre domain protein  34.38 
 
 		 149 aa  72.4  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0035  hypothetical protein  30.77 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.49607  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0353  helix-turn-helix domain-containing protein  25.73 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.747888  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2529  hypothetical protein  28.19 
 
 		 150 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.396332 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1909  prophage ps3 protein 01  34.45 
 
 		 165 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.7495  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0917  phage-associated protein  35.38 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2715  phage-associated protein-like  30.88 
 
 		 159 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1567  uncharacterized phage-associated protein  31.2 
 
 		 196 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1204  hypothetical protein  29.05 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000807308 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0895  phage-associated protein-like protein  28.97 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3930  hypothetical protein  25.15 
 
 		 174 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1211  CPW-WPC domain protein  30.83 
 
 		 153 aa  55.8  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101812 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2797  transcriptional regulator, XRE family  21.35 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4876  phage-associated protein  29.51 
 
 		 149 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136498  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1287  Putative phage-associated protein  32.56 
 
 		 169 aa  53.9  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1323  hypothetical protein  22.76 
 
 		 161 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338891  hitchhiker  0.00835036 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0451  hypothetical protein  26.75 
 
 		 183 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0057  transcriptional regulator, XRE family  28.42 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1316  hypothetical protein  30.21 
 
 		 214 aa  47.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000132332  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0071  helix-turn-helix domain-containing protein  24.73 
 
 		 335 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4719  uncharacterized phage-associated protein-like protein  23.23 
 
 		 166 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281895  normal  0.115987 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1233  hypothetical protein  31.03 
 
 		 127 aa  43.1  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1421  hypothetical protein  25.58 
 
 		 188 aa  42.7  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>