21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2797 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2797  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
306 aa  624  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000983915 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  26.62 
 
 
334 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5326  helix-turn-helix domain-containing protein  31.05 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000585614  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0353  helix-turn-helix domain-containing protein  30.43 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.747888  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2426  hypothetical protein  27.04 
 
 
336 aa  116  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0071  helix-turn-helix domain-containing protein  30.5 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0057  transcriptional regulator, XRE family  28.38 
 
 
326 aa  105  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4861  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 
333 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000181011  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1215  helix-turn-helix domain-containing protein  27.65 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  23.43 
 
 
332 aa  63.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0419  transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 
189 aa  60.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000615648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  21.91 
 
 
334 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4690  hypothetical protein  34.07 
 
 
183 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  21.35 
 
 
335 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1940  hypothetical protein  25.87 
 
 
184 aa  53.9  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0762  hypothetical protein  27.48 
 
 
183 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359066  normal  0.554709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  29.41 
 
 
339 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1316  hypothetical protein  27.18 
 
 
214 aa  46.2  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000132332  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  21.35 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2738  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 
95 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>