15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0762 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0762  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359066  normal  0.554709 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1940  hypothetical protein  39.05 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  31.47 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5326  helix-turn-helix domain-containing protein  31.96 
 
 		 328 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000585614  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0353  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 		 332 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.747888  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2797  transcriptional regulator, XRE family  27.48 
 
 		 306 aa  50.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983915 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0057  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 326 aa  48.9  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4690  hypothetical protein  39.66 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1224  hypothetical protein  30.28 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2426  hypothetical protein  27.94 
 
 		 336 aa  47.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3156  hypothetical protein  24.32 
 
 		 186 aa  44.7  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0071  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 335 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1156  hypothetical protein  31.08 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000314039  hitchhiker  0.00024151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4861  transcriptional regulator, XRE family  25.96 
 
 		 333 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000181011  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  42  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>